Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms