Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms