Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BAP07359 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms