Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms