Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms