Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
C9orf92A6NGG3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms