Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms