Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms