Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms