Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBM4Q9BWF3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms