Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LGMNQ99538 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms