Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms