Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RASSF3Q86WH2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASSF3Q86WH2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms