Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIGD3Q6B0B8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms