Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms