Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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