Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms