Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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IKZF1Q13422 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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IKZF1Q13422 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IKZF1Q13422 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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IKZF1Q13422 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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IKZF1Q13422 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IKZF1Q13422 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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