Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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