Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms