Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms