Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME5P56597 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms