Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK8P49336 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK8P49336 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK8P49336 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK8P49336 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms