Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHMT2P34897 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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