Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms