Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms