Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms