Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DAB2-211ENST00000511536 290 ntTSL 34.41□□□□□ -1.78e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.718e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP21-213ENST00000482792 552 ntTSL 44.37□□□□□ -1.718e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LMTK2-202ENST00000493372 540 ntTSL 44.36□□□□□ -1.718e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERGIC2-211ENST00000552155 693 ntTSL 34.35□□□□□ -1.718e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KIAA1143-202ENST00000484437 507 ntTSL 54.35□□□□□ -1.718e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.728e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GSTM4-207ENST00000478397 654 ntTSL 54.31□□□□□ -1.728e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-207ENST00000493787 6686 ntTSL 54.31□□□□□ -1.728e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SFI1-224ENST00000486708 651 ntTSL 24.3□□□□□ -1.728e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR11-203ENST00000470052 1009 ntTSL 34.29□□□□□ -1.728e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PDE4D-215ENST00000506510 558 ntTSL 44.28□□□□□ -1.728e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NUTM2B-AS1-203ENST00000477192 800 ntTSL 54.26□□□□□ -1.738e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CA5B-207ENST00000478923 578 ntTSL 24.25□□□□□ -1.738e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TM9SF3-205ENST00000485093 407 ntTSL 54.25□□□□□ -1.738e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CYB5R1-202ENST00000446185 680 ntTSL 54.23□□□□□ -1.739e-8■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-222ENST00000472032 549 ntTSL 44.22□□□□□ -1.738e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NAPG-206ENST00000582978 887 ntTSL 24.21□□□□□ -1.738e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-215ENST00000510870 537 ntTSL 44.19□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLS-212ENST00000471443 524 ntTSL 34.18□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PUM3-201ENST00000382032 458 ntTSL 24.18□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 34.18□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS13B-208ENST00000521037 486 ntTSL 54.18□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF6-207ENST00000498039 855 ntTSL 34.16□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRPS1-207ENST00000518018 813 ntTSL 24.16□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHL8-205ENST00000505388 606 ntTSL 44.15□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC02432-201ENST00000506645 592 ntTSL 34.13□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FNDC3A-203ENST00000484074 6082 ntTSL 1 (best)4.12□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 DLG2-226ENST00000530260 417 ntTSL 54.12□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DHX57-208ENST00000497514 584 ntTSL 34.12□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EZH1-224ENST00000593214 745 ntTSL 54.09□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERN1-202ENST00000577567 398 ntTSL 54.09□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 U2AF1L4-207ENST00000587886 263 ntTSL 34.09□□□□□ -1.758e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SART3-216ENST00000619503 770 ntTSL 34.07□□□□□ -1.768e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-206ENST00000589554 616 ntTSL 54.04□□□□□ -1.768e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.768e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.778e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLJ21408-203ENST00000566535 336 ntTSL 34.02□□□□□ -1.778e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.778e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MBOAT2-206ENST00000474341 713 ntTSL 54□□□□□ -1.778e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LSMEM1-205ENST00000486022 604 ntTSL 33.99□□□□□ -1.778e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.788e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TPGS2-212ENST00000590500 488 ntTSL 33.88□□□□□ -1.798e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.798e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLG1-210ENST00000565474 601 ntTSL 43.85□□□□□ -1.798e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-208ENST00000563830 570 ntTSL 53.85□□□□□ -1.798e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.81□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ACYP2-206ENST00000494922 829 ntTSL 53.8□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DAB2-205ENST00000503513 561 ntTSL 43.79□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATPAF1-206ENST00000492233 429 ntTSL 33.79□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BIVM-205ENST00000490317 1855 ntTSL 1 (best)3.79□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SENP6-206ENST00000474906 802 ntTSL 33.77□□□□□ -1.818e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.812e-15■■■■■ 107
SF3B1O75533 LIMA1-205ENST00000550592 567 ntTSL 43.72□□□□□ -1.818e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.818e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 33.7□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRRFIP1-206ENST00000464608 564 ntTSL 33.7□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C1D-207ENST00000485709 842 ntTSL 33.7□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAZ2B-215ENST00000541068 594 ntTSL 43.7□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLS-208ENST00000457316 821 ntTSL 43.7□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZFPM2-AS1-206ENST00000521622 394 ntTSL 33.7□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LIMA1-208ENST00000551691 583 ntTSL 33.67□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C12orf4-207ENST00000544258 727 ntTSL 33.66□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADTRP-204ENST00000485323 539 ntTSL 33.66□□□□□ -1.828e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMARCAD1-205ENST00000506089 554 ntTSL 43.64□□□□□ -1.838e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FAM114A2-205ENST00000518735 417 ntTSL 33.63□□□□□ -1.838e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CBWD2-207ENST00000468417 2973 ntTSL 1 (best)3.58□□□□□ -1.848e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASC4-206ENST00000558847 622 ntTSL 33.57□□□□□ -1.848e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DOCK2-210ENST00000520836 713 ntTSL 33.57□□□□□ -1.848e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 APOO-207ENST00000633609 412 ntTSL 33.55□□□□□ -1.848e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.848e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DAB2-210ENST00000509457 280 ntTSL 43.53□□□□□ -1.848e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.858e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TMEM161B-208ENST00000510089 7608 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.858e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STT3A-212ENST00000529886 542 ntTSL 43.5□□□□□ -1.858e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WASHC2A-206ENST00000454806 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 33.5□□□□□ -1.858e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SDHB-206ENST00000485092 636 ntTSL 23.49□□□□□ -1.858e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-218ENST00000568514 1018 ntTSL 33.44□□□□□ -1.868e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNPC3-205ENST00000527062 768 ntTSL 53.43□□□□□ -1.868e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZFPM2-AS1-202ENST00000518932 649 ntTSL 23.42□□□□□ -1.868e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.868e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EZH1-221ENST00000592492 535 ntTSL 53.4□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARID4A-209ENST00000466065 370 ntTSL 33.38□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 METTL2B-203ENST00000473488 465 ntTSL 33.38□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.37□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR3C1-211ENST00000504336 611 ntTSL 23.36□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPP6R3-207ENST00000525050 513 ntTSL 33.36□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TMEM131-204ENST00000438715 565 ntTSL 43.35□□□□□ -1.878e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OGT-205ENST00000459760 541 ntTSL 53.33□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-205ENST00000368295 1966 ntTSL 53.32□□□□□ -1.888e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SECISBP2-206ENST00000477484 617 ntTSL 33.32□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 NUB1-208ENST00000480907 977 ntTSL 53.32□□□□□ -1.888e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR2C1-217ENST00000552791 591 ntTSL 33.29□□□□□ -1.888e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABHD2-203ENST00000562254 787 ntTSL 53.29□□□□□ -1.888e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SECISBP2-204ENST00000440898 547 ntTSL 23.28□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.888e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TIA1-207ENST00000454815 911 ntTSL 53.27□□□□□ -1.898e-6■■■■■ 107
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