Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPLO60437 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPLO60437 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPLO60437 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms