Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLGNO14967 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms