Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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