Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNRNPCL3B7ZW38 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms