Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM8A1Q9UBU6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms