Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms