Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB7BQ96AH8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms