Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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