Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms