Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms