Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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