Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms