Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GMFG-210ENST00000601387 497 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC090092.1-202ENST00000533591 685 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms