Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms