Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPGP40121 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPGP40121 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPGP40121 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms