Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSHP23434 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSHP23434 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSHP23434 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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