Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRP12270 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TPRP12270 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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