Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms