Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms