Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms