Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms