Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms